El Consejo de Administracion es el órgano rector de FUNDAMIND, que dirige, administra, proporciona apoyo y supervisión a la organización. El mismo está integrado por 5 miembros cuyo mandato dura 3 años y puede ser reelecto indefinidamente. Dicho Consejo está regido por un estatuto social, aprobado y supervisado por la Inspección General de Justicia de la Nación, y tiene plena capacidad jurídica para adquirir derechos y contraer obligaciones que tengan relación directa o indirecta con el cumplimiento de su objeto social.